真正的閉關應該找一個寧靜的地方，讓自己有絕對獨處的環境及空間，最好是在一個寬闊的天然環境，與世隔離的密閉空間內。閉關靜坐時也要一切自然舒適，怎麼坐都行。如果坐不下去，很想睡，就躺下來睡。閉關不是整整七天從早到晚都在靜坐，而是靜坐35分鐘，躺5分鐘，每一場靜坐之後有休息時間，可以出去走動說話，吃零食，喝大量的水及上廁所（清洗身體中的毒素），再繼續靜坐。七天的閉關由每天四回合漸漸增加到六回合，再漸漸減到四回合。
閉關期間不是探測任何事情的時機，而是給神經系統有機會隨著大自然的能量，自由地排列組合。大家身上帶有的分子共振，在集體靜坐時會產生相乘倍數的能量場，譬如說，十個人一起靜坐，就會比一個人靜坐多出約一百倍的能量場（物理自然分子共振現象）並且不斷以能量排列組合不順的地方，使身體上或靈性上自癒的過程發生，自己能量或思想系統上就會有所轉化。
閉關期間，隨時有需要的話，主持閉關的長者會有談話的時段，可以回答一些關於修行的問題，解些疑惑。晚上一定要早睡，三餐要吃得好，譬如像Soma天然能量餐，或是以自然食品為主，一切都在放鬆狀態下進行，盡量不與外界連絡。閉關期間，靜坐中沒有什麼大起大落的情緒反應，不代表沒有收穫，也不需要與他人比較。
閉關期間也是傳授線引靜坐（第三層次）的最佳時刻。很多同修只要平常固定每日靜坐，時時探測自己的執著，在閉關後，經常會發現自己的靈性成長又邁進一大步。他們可能經過一場大清洗，清洗負面情緒、負面記憶，或潛意識的事情等，原本一直無法軟化的執著，就在閉關期間突然軟化了，或是內心智慧層次的突現或指示。這是「圓悟自癒中心」推行的一種很重要修行的方法之一。很重要的是，參加閉關後的二星期中，是穩定自己能量的時刻，千萬不要做有關改變個人人生的重大決定。